Artículo 10 de la Ley de Amnistía del Estado de México

Básicamente, cuando un juez decide darte la amnistía, él mismo le ordena a las autoridades correspondientes (como el Ministerio Público o la policía) que te liberen si ya estás detenido, o que ya no te sigan investigando si apenas iban a empezar un proceso penal en tu contra. En pocas palabras, el juez te saca del problema legal: o te sueltan o cancelan el juicio.

Texto oficial

Artículo 10. En la determinación que otorgue la amnistía, la autoridad judicial ordenará a las autoridades competentes que decreten la libertad o el desistimiento del ejercicio de la acción penal, según corresponda.